Dalam etiologi dan epidemiologi, ahli perubatan Muslim ertanggungjawab bagi jumpaan penyakit berjangkit dan sistem imunisasi, kemajuan dalam pathologi, dan hipotesis awal mengenai bakteriologi dan mikrobiologi.[35] Jumpaan mereka mengenai terutamanya mengenai penyakit berjangkit dianggap berevolusi dan satu dari jumpaan paling penting dalam perubatan.[15] Idea awal mengenai penyakit berjangkit boleh dijejak kepada beberapa hadith oleh Nabi Muhammad s.a.w. pada abad ke-7, yang dikatakan memahami sifat berjangkit kusta, kurap, dan penyakit jangkitan seksual.[3] Idea awal mengenai jangkitan timbul dari beberapa sikap bersimpati umum oleh pakar perubatan Muslim terhadap pesakit kusta (yang sering dilihat dari segi negatif oleh masyarakat kuno dan zaman pertengahan lain) yang boleh dijejak kembali melalui hadis disandarkan kepada Nabi Muhammad s.a.w. dan menurut nasihat yang diberikan dalam Al-Quran:[64]

"Tiada silap pada yang buta, dan jika tiada silap bagi yang pincang, dan tiada silap bagi yang sakit."

Ini akhirnya membawa kepada theori penyakit berjangkit, yang difahami sepenuhnya oleh Avicenna pada abad ke-11. Ketika itu, pathologi jangkitan telah difahami sepenuhnya, dan hasilnya, hospital dibuka dengan wad khusus bagi penyakit khas, agar merea dengan penyait berjangkit boleh dijauhkan daripada pesakit lain yang tidak mempunyai enyakit berjangkit.[65] In The Canon of Medicine (1020), Avicenna mendapati sifat jangkitan penyakit berjangkit seperti phthisis dan batuk kering, penyebaran penyakit melalu air dan tanah, dan memahami sepenuhnya sifat jangkian penyakit kelamin.[15] Dalam epidemiologi, dia memperkenalkan kaedah kuarantin sebagai cara menghadkan penyebaran penyakit berjangkit,[27] dan memperkenalkan kaedah analisa faktor risiko dan gagasan mengenai sindrom dalam diagnosis penyakit khusus.[33]

Supaya dapat mencari tempat yang terbersih untuk membina sebuah hospital, Muhammad ibn Zakarīya Rāzi (Rhazes) menjalankan sebuah eksperimen di mana dia menggantung kepingan daging di tempat-tempat di sepanjang abad ke-10 Baghdad dan memerhatikan daging yang decomposed kurang cepat. Razi juga menulis Buku Komprehensif Perubatan pada abad ke-9. Komprehensif Besar adalah yang paling dicarikan selepas kesemua penggubahannya, di mana Razi merakamkan kejadian klinkal pada pengalaman sendiri dan memberikan rakaman yang terguna pada pelbagai penyakit, dan juga penemuan campak dan cacar. Komprehensif Besar juga mengkritik pandangan-pandangan Galen, selepas Razi telah memerhatikan banyak kajian klinikal yang tidak mengikut penjelasan Galen pada demam. Contohnya, dia menyatakan penjelasan Galen pada ailment pundi kencing tidak tepat oleh kerana dia hanya melihat tida kejadian, sementara Razi mengajikan beratus-ratus kejadian seperti itu di hospital Baghdad dan Rayy.[66] Buku Komprehensif Perubatan, khususnya dengan pengenalannya pada campak dan cacar, telah menjadi berpangaruh di Eropah.

Ibn Zuhr (Avenzoar) adalah doktor yang pertama untuk memberikan suatu etiologi saintifik benar bagi penyakit inflamasi pada telinga, dan yang pertama untuk menjelaskan penyebab-penyebab stridor.[67] Dia juga memberikan penjelasan tepat pertama pada penyakit neurologikal, termasuk meningitis, intracranial thrombophlebitis, dan mediastinal germ cell tumors. Averroes bercadang kewujudan Penyakit Parkinson dan attributed ciri-ciri photoreceptor pada retina. Maimonides menulis tentang ketidakstabilan neuropsychiatrik dan menjelaskan rabies dan keracunan belladonna.[23]

Alergologi dan imunologi

Kajian alergologi dan imunologi berasal dari dunia Islam.[35] Muhammad ibn Zakarīya Rāzi (Rhazes) telah bertanggung jawab pada penemuan "asthma beralergi", dan adalah doktor pertama diketahui telah menulis rencana-rencana pada alergi dan sistem imun. Dalam Sense of Smelling, dia menjelaskan kemunculan rhinitis selepas membau sekuntum mawar sewaktu Musim Bunga. Dalam Rencana pada Alasan Mengapa Abou Zayd Balkhi Menderita dari Rhinitis Apabila Membau Mawar pada Musim Bunga, dia membincangkan rhinitis bermusim, yang adalah sama dengan athma beralergi atau demam hay. Al-Razi adalah orang yang pertama untuk menyedari bahawa demam adalah suatu mekanisme pertahan yang asli, cara badan melawan penyakit.

Perbezaan di antara cacar dan campuk juga berasal balik pada al-Razi. Tatacara perubatan pada inokulasi telah diamalkan pada zaman pertengahan Islam supaya dapat merawat cacar. Ini kemudian diikuti oleh vaksin cacar pertama dalam bentuk cowpox, dicipta di Turki pada awal abad ke-18.[68]

Hematologi

Dalam hematologi, Abu al-Qasim al-Zahrawi (Abulcasis) mengarang penjelasan pertama pada haemophilia dalam Al-Tasrif, di mana dia mengarangkan sebuah keluarga Andalusia yang ahli lelakinya meninggal dunai disebabkan berdarah selepas injury kecil.[69]

===Mikroorganisme===http://ms.wikipedia.org/w/index.php?title=Perubatan_pada_zaman_pertengahan_Islam&action=edit&section=17Doktor Islam berspekulasi pada kewujudan bakteria dan mikroorganisme, walaupun teori-teori awal tidak dibuktikan atau diperhatikan hingga abad ke-17, apabila penyelidikan pada mikrobiologi hanya dibuat boleh dengan penciptaan mikroscop. Gagasan awal ini, meskipun, mempengaruhi Girolamo Fracastoro.

Avicenna memhipothesis rembesan tubuh dikotori oleh badan bumi asing sebelum dikenakan penyakit.[13][34]

Apabila wabak bubonic Kematian Hitam mencapai al-Andalus pada abad ke-14, Ibn Khatima berhipothesiskan bahawa penyakit berjangkit disebabkan oleh "tubuh minit" kecil yang memasuki tubuh manusia dan dapat menyebabkan penyakit. Seorang lagi doktor abad ke-14 Andalusia, Ibn al-Khatib (1313-1374), menuliskan suatu perjanjian bergelar On the Plague, yang dia menyatakan:[13]

"Kemunculan penjangkitan ditubuhkan dengan pengalaman, penyiasatan, bukti pancaindera dan laporan amanah. Kenyataan ini membentukkan suatu perdebatan kukuh. Kenyataannya pada penjangkitan menjadi jelas pada penyiasat yang menyatakan bagaimana dia menubuhkan hubungan dengan yang dijangkiti aftlicted mendapatkan penyakit, sedangkan dia tidak berhubungan tetap selamat, dan bagaimana penjangkitan dikesan melalui pakaian, vessel dan subang."

Parasitologi

Dalam parasitologi, Ibn Zuhr, melalui pembelahannya, dapat membukti bahawa kudis penyakit kulit disebabkan oleh suatu parasit, suatu penemuan yang akan merosakkan teori humorisme disokonh oleh Hippocrates, Galen dan Avicenna. Pengalihan parasit dari badan pesakit tidak terlibat purging, berdarah, atau mana-mana rawatan tradisional lain berkaitan dengan empat humor.[43]